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2025-10-19 0
咱们这辈子难免跟医院打交道,小到发烧感冒,大到癌症感染,每一次求医问药,其实都在盼着能有更有效、副作用更小的药。
可很少有人知道,新药研发从来都是场“马拉松”,往往十年磨一剑,花几十亿美金,最后还可能竹篮打水一场空。
尤其是面对越来越难对付的超级细菌和顽固癌症,科学家们早就愁得头都大了——直到最近,一款能“读懂细菌语言”的AI横空出世,这事才算有了新指望。
你可能没听过“套索肽”这三个字,但这东西是细菌藏了亿万年的“宝贝”。
细菌在地球上活了几十亿年,为了生存早就进化出了独门绝技,套索肽就是它们造出来的“秘密武器”。
具体来说细菌体内有个叫核糖体的“小工厂”,先把氨基酸串成一条线性的长链,就像一根没打结的绳子,然后再由专门的生物合成酶上阵,把这根绳子折来折去,打成一个紧实的“活结”,这就成了套索肽。
别小看这个“绳结”,那可是自然界的神来之笔。这种结构特别稳定,就像手工编的中国结似的,不容易被分解,而且功能五花八门——有的能杀其他细菌,有的能抑制病毒,甚至还有的能对付癌细胞。
更妙的是,它个头小、靶向性强,既能精准瞄准病灶,又有潜力做成口服药,不用天天打针输液,对病人来说简直是天大的好事。
美国范德堡大学的道格·米切尔教授就说,套索肽在药物研发里的潜力大得很,可惜以前咱们一直没摸透它的脾气。
问题出在哪?简单说就是“看不懂”,自然界的套索肽有几千种,每一种的“绳结”打法都不一样,而要让它发挥作用,关键得找对“打结师傅”——一种叫“套索环化酶”的物质。
就像不同的锁得配不同的钥匙,每种套索肽都得靠特定的环化酶才能打出那个关键的结,缺了这个配对,套索肽就是根没用的“废绳子”。
以前科学家想找这种配对,只能靠瞎试,今天拿这个肽配那个酶,明天换个组合再试,整个过程就像大海捞针,往往耗上几年也没结果。
更头疼的是,连现在最牛的AI都帮不上忙,你肯定听过AlphaFold吧?就是谷歌DeepMind搞出来的那个能预测蛋白质结构的AI,在生物学界算是顶流了。
可即便强如AlphaFold,碰到套索肽也犯迷糊。伊利诺伊大学的迪瓦卡尔·舒克拉教授解释说,不是AlphaFold不行,是套索肽太特殊了。
它的绳结结构太复杂,而且相关的实验数据特别少,AlphaFold的训练库里根本没多少这方面的“经验”,自然就预测不准。
这就好比让一个只会开货车的司机去开战斗机,不是能力不够,是根本没学过对应的技术。
AlphaFold擅长的是常规蛋白质的结构预测,但套索肽的“语言”太独特,它既包括氨基酸的排列顺序,又涉及绳结的三维结构,还有酶和肽之间的相互作用,这些细节通用AI根本抓不住。
舒克拉团队的博士米玄楠就说,因为数据少、相互作用复杂,预测套索肽的特性一直是个老大难问题。
直到最近,舒克拉和米切尔的团队联手搞出了一款专门对付套索肽的AI——LassoESM,这事才算有了突破。
这成果还发在了《自然·通讯》上,懂行的都知道,能上这个期刊的研究,含金量绝对够格。
这款AI的厉害之处,就在于它是“量身定制”的。米切尔的团队先当“侦察兵”,用生物信息学的方法在各种微生物里筛了个遍,找出了几千条套索肽的序列。
为了保证数据靠谱,他们还一条一条地人工验证,生怕漏了关键信息或者弄错了数据——毕竟AI学得好不好,全看喂的“料”扎不扎实。
然后就轮到舒克拉团队的“AI训练课”了。他们用了一种叫“掩码语言模型”的方法,说穿了就是给AI玩“猜字游戏”:把套索肽的氨基酸序列遮掉一部分,让AI根据剩下的部分猜被遮的是什么。
就像咱们看文章时,哪怕漏了几个字,也能根据上下文猜个大概,AI就是靠这个过程,慢慢摸清了套索肽的“语法规则”。
哪种氨基酸该在哪个位置,什么样的序列能打出什么样的结,酶和肽得怎么配对才能成功“打结”。
等AI把这些规律摸透了,真正的本事就显出来了,它最核心的能力,就是仅凭套索肽的氨基酸序列,就能准确预测出哪种套索环化酶能给它“打结”。
这一下就把以前的难题解决了:以前得靠几年的实验试错,现在AI分分钟就能给出答案;以前连酶和肽能不能配对都不知道,现在不仅能知道,还能顺着这个规律改造酶,理论上甚至能把任意氨基酸链都打成稳定的套索结构。
更绝的是,这AI还是个“学霸”——就算训练数据不多,预测得照样精准。
要知道,搞科研经常碰到数据不足的问题,很多AI没足够的“养料”就罢工了,可LassoESM不一样,米玄楠博士说,他们的研究证明了这模型就算“吃的少”,也能把套索肽的特性猜得准准的。
这对科研人员来说简直是雪中送炭,毕竟套索肽的实验数据本来就稀缺,要是AI还挑三拣四,那真没法干活了。
而套索肽正好是超级细菌的“克星”,它的作用机制跟普通抗生素不一样,不容易让细菌产生耐药性。
以前因为摸不透它的规律,没法大规模开发,现在有了LassoESM,就能快速筛选出有效的套索肽,以后再碰到耐药菌感染,就不用眼睁睁看着没药可用了。
再说说癌症,现在的抗癌药不少,但很多要么副作用大,要么靶向性差,杀癌细胞的同时也伤正常细胞。
套索肽的优势就是靶向性强,能精准盯着癌细胞打,而且那个稳定的绳结结构能让它在体内保持活性,做成口服药还方便病人服用。
有了AI帮忙设计,以后就能针对性地开发出对付肺癌、肝癌这些顽固癌症的新药,说不定副作用能小很多,病人的生活质量也能提上去。
舒克拉教授说,这模型只是个开始,他们接下来打算给更多类型的肽类天然产物做专属AI,还想让AI直接设计出新的套索肽——比如专门瞄准某种癌症蛋白的,或者能对付新型病毒的。
到那时候,药物研发就不是“碰运气”,而是“按需定制”,效率能翻好几倍。
想想这事多神奇,细菌在微观世界里默默打了几十亿年的绳结,每一个结都是生存的智慧,里面藏着对抗疾病的密码。
以前咱们就像门外汉,拿着放大镜一点点抠,还未必能看懂;现在有了能“读懂绳结语言”的AI,一下子就把这亿万年的秘密解开了。
这已经不只是“破译密码”了,咱们还能顺着这密码“编新话”——用细菌的古老智慧,造出让人类更健康的新药。
从AlphaFold预测蛋白质结构,到现在LassoESM读懂套索肽语言,AI正在一点点“解锁”生命的奥秘。
以前总觉得癌症、超级感染是治不好的顽疾,可现在看来,随着AI越来越懂生命的“语法”,这些顽疾被攻克的日子可能真的不远了。
说到底科学的进步从来都是这样:先读懂自然,再利用自然,最后超越自然。细菌用亿万年织就的“绳结”,以前是它们的生存武器,现在有了AI当“翻译官”,这些武器就要变成人类对抗疾病的利器了。
下一个被攻克的顽症会是什么?谁也说不准,但可以肯定的是,当机器真正懂了生命的语言,医学的未来只会更值得期待。
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